La situación de los pueblos indígenas y de la diversidad biológica en África es compleja y variada, ya que se encuentran muchas comunidades indígenas y ecosistemas muy diferentes en todo el continente. Sin embargo, en general, muchos pueblos indígenas de África enfrentan retos importantes para mantener sus formas de vida tradicionales y proteger sus tierras y recursos naturales

Una de las amenazas a los pueblos indígenas y la biodiversidad en África es la invasión proveniente de la minería, la agricultura y los proyectos de infraestructura. Esto resulta a menudo en el desplazamiento de las comunidades indígenas y la destrucción de sus tierras y recursos naturales, lo cual puede tener efectos devastadores sobre las personas y los ecosistemas de los que dependen.

Otra amenaza es la creación y la gestión de las áreas protegidas en las tierras indígenas en África. Aunque estos proyectos de conservación tienen como objetivo la protección de la biodiversidad, al hacerlo desalojan pueblos indígenas y comunidades locales de las tierras que han protegido y manejado de manera sostenible por generaciones.

Un desafío importante es la falta de reconocimiento y protección de los derechos de los pueblos indígenas por parte de muchos gobiernos africanos, que a menudo no consultan con las comunidades indígenas ni obtienen su consentimiento libre, previo e informado antes de autorizar proyectos de desarrollo en sus tierras. Esto lleva a conflictos y abusos de derechos humanos, así como a la pérdida de conocimientos culturales y ecológicos importantes.

Muchas organizaciones indígenas comunitarias, como por ejemplo CIPDP e IIN en Kenia, siguen trabajando para lograr la protección de sus tierras y recursos naturales, frecuentemente con el apoyo de organizaciones internacionales y grupos de la sociedad civil. Estos esfuerzos incluyen la incidencia y las acciones legales, además de iniciativas de conservación basadas en la comunidad que buscan promover el uso sostenible de la tierra y la conservación de la diversidad biológica, respetando los derechos y conocimientos indígenas.